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第123章 种质信息管理(第1页)

一、种质信息管理

种质资源的保存,除资源材料本身外,还应包括种质资源的各种资料,对每份资源材料均应有其档案,档案资料在条件许可时,应输入计算机储存,建立数据库,以便于资料检索、分类和开展有关的研究工作。

目前,世界上不少国家和国际农业研究机构都相继建立了种质信息计算机管理系统。尽管其规模、组织和功能方面存在差异,但它们的作用大体相同。

我国已建成国家作物种质资源信息系统(cgRIs)

1、种质数据类型

基础数据:包括登记材料数据和搜集数据、登记材料号、采集编号

鉴定和评价数据:植物学性状、经济性状、品质性状、对病虫害的反应、对环境的适应性

管理数据:包括接纳日期、种质编号、入库定位种子起始芽率等等。

交换数据:交换目录内有关种引进和分的数据。

2、种质信息系统类型

种质信息系统按其主要特征分为三类:

(1)文件系统

(2)数据库系统

(3)网络系统(美国的gRIn)

3、植物遗传资源协作网:在国际上建立起来的种质信息管理与交换系统。建立植物遗传资源协作网目的是利用长期种质库妥善保存种质资源,通过数据库系统提供信息和资料,并借助中期库分种质资源。

(1)地区协作网

(2)作物协作网

(3)长期库协作网

(4)以课题为基础的协作网

二、核心样品的建立

1、核心种质的含义

澳大利亚科学家Franke1(1984)次提出了核心收集品的概念,并与bron(1989)对其做了进一步展和完善。核心样品(net):是指用最小的种质资源样品量最大程度的代表种质资源的遗传多样性。

一般来说,一个物种的核心种质约占其全部种质的5-1o%,至少代表该物种7o%的遗传多样性。

IbpgR(国际植物遗传资源委员会)认为,核心种质库是能以最少的重复代表一个种及野生近缘种的形态特征、地理分布、基因与基因型的最大范围的遗传多样性。

近年来,核心种质的概念已延伸到无性繁殖作物、dna种质库及种质资源的原位保存研究领域

核心种质应具有异质性、多样性、代表性、实用性和动态性

2、构建核心种质的方法

核心种质的构建有以下几种方法:

(1)按产地来源进行构建

(2)按分类系统进行构建

(3)按农艺性状表现进行构建

(4)利用分子标记进行构建

以上方法结合使用,构建核心种质更为准确

3、建立核心样品的程序

(1)资料收集:从种质信息管理系统

(2)分组:将具有相似性状的样品归为一类,逐级分类,没有资料的样品单独分组。

(3)选择:即确定每组选择的数量和对象

(4)建立核心样本(库):对选择出来的核心样品进行鉴定,确保它们是来自不同组的代表,繁殖核心样品,建立该种作物核心种质库。

建成的核心种质库需不断完善、更新

4、展核心种质应注意的几个问题

(1)核心种质不能替代整个种质搜集品。

(2)核心种质的构建需要多学科的交叉知识。

(3)核心种质的构建还没有一套成型的理论。

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